2030 год. Прогресс в области кибернетики позволяет людям заменять собственные конечности на усовершенствованные механические протезы. Майор Мотоко Кусанаги, сотрудница 9-го отдела службы безопасности, занимается расследованием деятельности загадочного хакера, известного под именем Кукловод.
В ходе расследования майор Кусанаги сталкивается со сложной сетью киберпреступлений, где каждый шаг приближает её к разгадке личности таинственного злоумышленника. Дело осложняется тем, что Кукловод демонстрирует невероятные способности в управлении цифровым пространством, бросая вызов всей системе безопасности.